اولین گزارش از ویروس رگه زرد اختر در ایران

نوع مقاله : مقاله کوتاه

نویسندگان

1 مرکز تحقیقات ویروس‌شناسی گیاهی، دانشگاه شیراز، شیراز، ج. ا. ایران

2 گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، تهران ج. ا. ایران

10.22099/iar.2023.47324.1540

چکیده

اختر (Canna indica) گونه ­ای از خانواده اختر (Cannaceae)، یک گیاه زینتی چند­ساله است که به­ طور گسترده در طراحی فضای سبز استفاده می­ شود. گونه های متفاوتی از ویروس ­های بیمارگر گیاهی این گیاه را آلوده نموده و به ­عنوان یک تهدید مهم برای گیاه اختر محسوب می­شوند که منجر به طیف وسیعی از علائم در گیاهان اختر، کاهش ارزش کیفی زینتی آن ها و همچنین مواد تکثیر شده با کیفیت پایین‌تر و منجر به خسارت مالی قابل‌توجهی می‌شوند. یک پوتی­ویروس جدید به نام ویروس رگه زرد اختر (CaYSV) بسیاری از ارقام اختر را در فضای ­سبز که به دلیل ارزش زینتی خود به طور گسترده کشت می شوند آلوده می ­کند.  این ویروس بسیاری از ارقام اختر را که در باغ ها یافت می شوند آلوده کرده است و منجر به نگرانی قابل توجهی در محیط های باغبانی شده است. طی بررسی انجام شده در تابستان 1401، علائم سبزردی شدید در امتداد رگبرگ­ های اختر در فضای­ سبز شهر یزد (ایران) مشاهده شد. آر ان ای کل از برگ­های 20 نمونه­ ی اختر دارای علائم و یک نمونه بدون علائم و به ظاهر سالم (کنترل منفی) استخراج و واکنش زنجیره­ای پلی­مزار معکوس (RT-PCR) با استفاده از یک جفت آغازگر دژنره پوتی­ویروس­ ها (Nib2F, Nib3R) انجام شد. RT-PCR منجربه تکثیر یک قطعه دی ان ای با اندازه مورد انتظار (تقریبا باندازه 350 جفت ­باز) در تمام نمونه­ های دارای علائم شد، در­حالی که هیچ قطعه دی ان ائی در گیاه بدون علائم مورد آزمایش تکثیر نشد. قطعه دی ان ای تکثیرشده به­روش سنگر توالی ­یابی شدند و اندازه آن دقیقاً 350 جفت باز تعیین شد. تجزیه و تحلیل BLASTn توالی نوکلئوتیدی جدایه ­های مورد­ نظر با سایر جدایه­ های  CaYSV متناظر موجود در پایگاه ژنی نشان داد، جدایه­ یزد بیشترین شباهت (5/99%) را با جدایه­ ای از روسیه با رس­شمار MG545919.1  و کمترین شباهت (59/89%) با جدایه ­ی CaYSV از انگلستان با رس ­شمار  EF466139.1  دارد.

کلیدواژه‌ها


Alexandre, M. A. V., Duarte, L. M. L., Chaves, A. L. R., Ramos, A. F., Harakava, R., & Kitajima, E. W. (2017). Canna paniculata as natural host of canna yellow streak virus in Brazil. Australasian Plant Disease Notes, 38, Notes 12.‏ https://doi.org/10.1007/s13314-017-0264-3
Andrade‐Mahecha, M. M., Tapia‐Blácido, D. R., & Menegalli, F. C. (2012). Physical–chemical, thermal, and functional properties of achira (Canna indica L.) flour and starch from different geographical origin. Starch‐Stärke, 64(5), 348-358. https://doi.org/10.1002/star.201100149
Beemster, A. B. R. (1982). Handbook of plant virus infections. Comparative diagnosis. Netherlands Journal of Plant Pathology, 88, 216–217. https://doi.org/10.1007/BF02140885
Castillo, B. S., Yarwood, C. E., & Gold, A. H. (1956). Canna-mosaic virus. Plant Disease Reporter, 40, 169-172. DOI 10.1007/s13314-012-0062-x
Chauhan, R. P., Hamon, H. F., Rajakaruna, P., Webb, M. A., Payton, M., & Verchot, J. (2015). Reliable detection for Bean yellow mosaic virus, Canna yellow streak virus, and Canna yellow mottle virus in canna varieties with red foliage. Plant Disease, 99(2), 188-194.‏ https://doi.org/10.1094/PDIS-05-14-0538-RE
Deng, D., McGrath, P. F., Robinson, D. J., & Harrison, B. D. (1994). Detection and differentiation of whitefly‐transmitted geminiviruses in plants and vector insects by the polymerase chain reaction with degenerate primers. Annals of Applied Biology, 125(2), 327-336. https://doi.org/10.1111/j.1744-7348.1994.tb04973.x
Hollings, M., & STONE, O. M. (1973). Some properties of chrysanthemum stunt, a virus with the characteristics of an uncoated ribonucleic acid. Annals of Applied Biology, 74(3), 333-348. https://doi.org/10.1111/j.1744-7348.1973.tb07754.x
Gibbs, A., & Mackenzie, A. (1997). A primer pair for amplifying part of the genome of all potyvirids by RT-PCR. Journal of Virological Methods, 63(1-2), 9-16.‏ https://doi.org/10.1016/S0166-0934(96)02103-9
Kumari, A., Kaur, C., Kumar, S., Chauhan, P. S., & Raj, S. K. (2021). Current status of three virus genera (Badnavirus, Cucumovirus, and Potyvirus) in Canna Species in India. In Raj, S. K., Gaur, R. K., & Yin, Z. (Eds). Virus Diseases of Ornamental Plants: Characterization, Identification, Diagnosis and Management (pp 117-126).‏ Singapore: Springer. https://doi.org/10.1007/978-981-16-3919-7_6
Li, Y., Tan, G., Lan, P., Zhang, A., Liu, Y., Li, R., & Li, F. (2018). Detection of to bamoviruses by RT-PCR using a novel pair of degenerate primers. Journal of Virological Methods, 259, 122-128.‏ https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2018.06.012
Li, Y., Xia, F., Wang, Y., Yan, C., Jia, A., & Zhang, Y. (2019). Characterization of a highly divergent Sugarcane mosaic virus from Canna indica L. by deep sequencing. BMC Microbiology , 19, 1-8.‏ https://doi.org/10.1186/s12866-019-1636-y
Lockhart, B. E. L. (1988). Occurrence of Canna yellow mottle virus in North America. In VII International Symposium on Virus Diseases of Ornamental Plants 234 (pp. 69-72). https://doi.org/10.17660/ActaHortic.1988.234.7
Mitrofanova, I. V., Zakubanskiy, A. V., & Mitrofanova, O. V. (2018). Viruses infecting main ornamental plants: An overview. Ornamental Horticulture, 24, 95-102.‏ https://doi.org/10.14295/oh.v24i2.1199
Monger, W. A., Harju, V., Skelton, A., Seal, S. E., & Mumford, R. A. (2007). Canna yellow streak virus: A new potyvirus associated with severe streaking symptoms in canna. Archives of Virology, 152(8), 1527-1530. https://doi.org/10.1007/s00705-007-0977-2
Punsasi, R., Mark, P., & Jeanmarie, V. (2015). Reliable detection for bean yellow mosaic virus, Canna yellow streak virus, and Canna yellow mottle virus in Canna varieties with red foliage.‏ https://doi.org/10.1094/PDIS-05-14-0538-RE
Rajakaruna, P., Shafiekhani, M., Kim, T., Payton, M., Chauhan, R., & Verchot, J. (2014). Production of discernible disease phenotypes in Canna by five plant viruses belonging to the genera Potyvirus, Cucumovirus and Badnavirus. Plant Pathology, 63(4), 821-830. https://doi.org/10.1111/ppa.12169
Rizos, H., Gunn, L. V., Pares, R. D., & Gillings, M. R. (1992). Differentiation of cucumber mosaic virus isolates using the polymerase chain reaction. Journal of General Virology, 73, 2099-2103. https://doi.org/10.1099/0022-1317-73-8-2099
Rojas, M. R., Gilbertson, R. L., Russell, D. R., & Maxwell, D. P. (1993). Use of degenerate primers in the polymerase chain reaction to detect whitefly-transmitted geminiviruses. Plant Disease, 77(4), 340-347. https://doi.org/10.1094/pd-77-0340
Yamashita, S., Natsuaki, T., Doi, Y., & Yora, K. (1985). Canna yellow mottle virus, a non-enveloped small bacilliform virus in Canna sp. Japanese Journal of Phytopathology, 51(5), 642-646. https://doi.org/10.3186/jjphytopath.51.642
Zakubanskiy, A. V., Mitrofanova, I. V., & Chirkov, S. N. (2017). Molecular characterization of viruses infecting canna in Russia. European Journal of Plant Pathology , 149, 923-931.‏ https://doi.org/10.1007/s10658-017-1241-6