Specific Primers For Identification and Detection of Three Major Desert Truffle Species in Iran with Special Reference to Terfezia claveryi

Document Type : Full Article

Authors

Shiraz University

Abstract

ABSTRACT- Desert truffles are hypogeous ascomyceteous ectomycorrhizal fungi, occurring in arid and semi-arid ecosystems. A PCR-based method was developed for the identification of 3 major desert truffles of Iran: Terfezia claveryi, Tirmania pinoyi and Tirmania nivea based on internal transcribed spacers of rDNA. Two specific PCR primers were designed for T. claveryi, 4 for T. pinoyi, and 2 for T. nivea. All primers were specific to their homologous species and neither set amplified purified DNA from other truffle species or soil-borne micromycetes. In conventional PCR, the limits of detection were 10-500 pg DNA.  ITS-Tfc1 primers detected the species in host tissues using a nested-PCR method by ITS1 and ITS4 universal primers as external set.

Keywords

Article Title [Persian]

آغازگرهای اختصاصی برای شناسایی و ردیابی سه گونه دنبلان کوهی غالب ایران با تأکید بر Terfezia claveryi

Authors [Persian]

  • رضا مستوفی‌زاده قلمفرسا
  • ضیاءالدین بنی‌هاشمی
  • صمد جمالی
دانشگاه شیراز
Abstract [Persian]

چکیده- دنبلان­های کوهی، آسکوکارپ زیرزمینی برخی آسکومیست­های قارچ­ریشه­ای هستند که در زیست­بوم­های نیمه خشک یافت می­شوند برای شناسایی سه دنبلان کوهی عمده­ی ایرانی:  Terfezia claveryi، Tirmania pinoyi و Tirmania nivea روشی مبتنی بر واکنش زنجیره­ای پلیمراز بر اساس توالی­­های جداکننده­ی نسخه­برداری شده­ی داخلی در دی­اِن­اِی ریبوزومی ابداع گردید. دو آغازگر اختصاصی برای Terfezia claveryi، چهار آغازگر اختصاصی برای Tirmania pinoyi و دو آغازگر اختصاصی برای Tirmania nivea طراحی شد. کلیه­ی آغازگرها نسبت به گونه­ی خودی­شان اختصاصی بودند و هیچ­کدام دی­اِن­اِی خالص شده از سایر دنبلان­ها و از برخی از ریزقارچ­های خاک­برد را تکثیر نکردند. در واکنش زنجیره­ای پلیمراز سنتی، حد ردیابی دی­اِن­اِی 10 تا500 پیکوگرم اندازه­گیری شد. مجموعه آغازگر ITS-Tfc1 با استفاده از واکنش زنجیره­ای پلیمراز تودرتو و به کمک آغازگرهای عمومی ITS1 و ITS4 قادر به ردیابی گونه­ی مربوطه در بافت گیاه میزبان بود

Keywords [Persian]

  • واژه های کلیدی: آغازگرهای اختصاصی گونه
  • توالی‌‌های جداکننده‌ی نسخه‌برداری شده‌ داخلی دی‌‌اِن‌‌اِی ریبوزومی
  • دنبلان کوهی
  • قارچ‌‌ریشه‌های برونی
Iran Agricultural Research
Volume 33, Issue 1 - Serial Number 1
September 2014
Pages 29-42

Files

Share

How to cite

Statistics